短發(fā)夾RNA(short hairpin RNA, shRNA)是一種經(jīng)由載體遞送并穩(wěn)定表達(dá)的RNA分子,其可在細(xì)胞內(nèi)被加工成小干擾 RNA(siRNA),進(jìn)而引導(dǎo)RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)降解靶信使RNA(mRNA),從而實現(xiàn)特異性基因敲低。單個 shRNA 實驗只能研究一個特定基因的功能。然而,生物學(xué)中的絕大多數(shù)現(xiàn)象(如細(xì)胞增殖、死亡、分化、癌癥發(fā)生、藥物反應(yīng)等)都不是由單個基因決定的,而是由復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)共同調(diào)控的。因此,要全面理解這些過程,就需要一種能夠同時、系統(tǒng)地干擾大量基因并進(jìn)行篩選的方法。
建立 shRNA 文庫的根本原因是生物學(xué)問題的復(fù)雜性,其核心作用是將 RNAi 技術(shù)轉(zhuǎn)化為一種強大的大規(guī)模發(fā)現(xiàn)工具。泓迅生物利用專利的Syno?合成技術(shù)平臺,可以快速高效地實現(xiàn)高質(zhì)量 shRNA 文庫構(gòu)建,滿足不同客戶對文庫的定制化需求,為大規(guī)模功能缺失篩選提供高效且經(jīng)濟的解決方案。
| 服務(wù)項目 | 服務(wù)詳情 | 周期 |
|---|---|---|
| shRNA 設(shè)計 | 針對目標(biāo)基因進(jìn)行 shRNA 序列設(shè)計 每個基因設(shè)計3-6條 shRNA(無物種限制) | 2-3天 |
| 芯片合成 | 將所設(shè)計的所有 shRNA 及陰性對照合成在一張芯片上 | 3-4周 |
| shRNA 文庫構(gòu)建 | 將 shRNA 構(gòu)建到客戶的目標(biāo)載體上 | 4周 |
| 文庫質(zhì)粒大抽 | 根據(jù)發(fā)貨量進(jìn)行轉(zhuǎn)染級質(zhì)粒抽提 | 1周 |
| 文庫質(zhì)檢及 NGS 驗證 | 庫容量大于100x、覆蓋率>90%,文庫正確率>65% | 2-3周 |
| 病毒包裝 | 病毒滴度>108TU/mL | 2-3周 |
